迷你麝香龟,作为一种和普通麝香龟即没区分出亚种的龟,它的背甲腹甲包括花纹是基本类似的,不会把它和其它种的龟搞混,这就象北种乌龟E和南种乌龟E,尽管没有区分亚种,但是两个一眼就能看出来不同。迷你麝香的主要特征是在个体上公龟成体在5至6厘米,母龟成体在7至8厘米,是世界上最小的且长不大的龟。成体迷你麝香龟不论公母,都前窄后宽,迷你麝香成体色深,基本是黑色。
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